El 6 de abril de 1869 nacieron los mellizos Elías y Ezequiel Jiménez Rojas, en el seno del matrimonio de Ezequiel Jiménez Vargas y Feliciana Rojas Murillo de Jiménez. En esa época, la familia vivía en San José centro, frente al antiguo Colegio Seminario (avenida 4 y calles 1 y 3).
La madre de Ezequiel era una habilidosa dibujante. Mientras cursaba la enseñanza media, sus pinturas y dibujos fueron premiados en varias ocasiones. La inclinación por las artes plásticas le vino a Ezequiel por vía materna.
Dada la escasez de casas de enseñanza artística en Costa Rica, Ezequiel comenzó a pintar por sí mismo en 1881, a los doce años de edad. Ya desde este momento se decantó a favor del paisaje.
Poco después, ingresó en el Instituto Nacional, que había sido separado de la Universidad de Santo Tomás y había adquirido un carácter de institución particular. El Instituto estaba dirigido por Valeriano Fernández Ferraz, el primero que en nuestro país enseñó Historia de las Artes, en el colegio San Luis Gonzaga.
Cerca de 1885, Jiménez recibió clases del artista Henry Etheridge por iniciativa de su madre, que había advertido las aptitudes de su hijo para con la pintura. Etheridge había sido profesor de arte en South Kensington, Londres, y en Costa Rica no solo formó a Jiménez, sino también a Enrique Echandi.
En 1896, el Gobierno contrató al pintor español Tomás Povedano de Arcos para organizase y dirigiera la Escuela Nacional de Bellas Artes. Cuando esta abrió sus puertas, Ezequiel Jiménez se matriculó gracias a un permiso especial concedido por el presidente Rafael Yglesias Castro, ya que el joven artista era un funcionario público que laboraba para el Ferrocarril al Pacífico.
Ezequiel Jiménez permaneció en ese centro de enseñanza hasta el año de 1914.
Años después, hacia el final de la década de 1940, la crisis política del país lo obligó a trasladarse con su familia a Nicaragua, donde permaneció hasta 1952. Al final de su vida, su vista fue debilitándose de manera irreversible.
Ezequiel Jiménez falleció en San José el 4 de marzo de 1957.