El sismo más fuerte se produjo en esta isla volcánica de la prefectura de Tokio.
Su epicentro se encontraba a 20 km de profundidad, señaló la agencia japonesa que indicó que no existía un riesgo de tsunami.
Las ondas sísmicas se sintieron en un amplia zona, incluyendo Tokio.
"Escuché un estruendoso ruido y todo se movió", explicó en la televisión una habitante de la isla.
"Por el momento, no se ha registrado heridos", añadió.
Situado sobre cuatro placas tectónicas, el archipiélago nipón registra cada año el 20% de los sismos más fuertes del planeta.
El sábado por la mañana, un sismo de magnitud 6,3 sacudió el oeste de Japón, cerca de la ciudad portuaria de Kobe, dejando al menos 24 heridos.
El domingo, un sismo de magnitud 5,2 sacudió la costa japonesa de la prefectura de Fukushima sin que se registrara ninguna anomalía en la central nuclear Fukushima Daiichi.