El nombramiento de John Allen como alto comandante supremo de la OTAN fue suspendido luego de la apertura de una investigación sobre correos clasificados como "fuera de lugar" respecto de una aventura amorosa, que fueron descubiertos en el marco de una investigación sobre la relación adúltera mantenida por el exdirector de la CIA David Petraeus.
Al término de su investigación la inspección general "exonera completamente" al general Allen de toda conducta inconveniente para un oficial y por tanto de toda violación del reglamento militar, según el responsable, que habló en condición de anonimato.
El general de cuatro estrellas se había visto salpicado por el desarrollo del caso Petraeus, que surgió al descubrirse la relación extramatrimonial mantenida entre el exgeneral y jefe de la CIA y Paula Broadwell, su biógrafa 20 años menor que él. El escándalo supuso la dimisión de Petraeus de la CIA el 9 de noviembre.