Yasser Corona, al minuto 55, y Damián Manso, al 57, anotaron los goles para los mexicanos que se impusieron con facilidad, en un juego disputado en una cancha húmeda por una fuerte lluvia que cayó previamente.
Corona con un cabezazo ante un centro de Manso marcó el 1-0 y dos minutos después el mismo jugador anotador desbordó por la izquierda, centró al frente del área a donde llegó Manso y puso el 2-0 con un derechazo violento.
El Morelia había goleado 4-0 al Motagua en el partido de ida el 25 de agosto, disputado en el estadio Morelos de la ciudad de Morelia.
En el mismo grupo, Liga Deportiva Alajuelense derrotó el miércoles 1-0 a Los Angeles Galaxy de Estados Unidos en la ciudad costarricense de Alajuela.
Con este resultado Morelia llegó a nueve puntos, misma cantidad que la Liga pero con más goles a favor, por lo que es líder del grupo A. El Galaxy fue relegado al tercer puesto con seis unidades y el Motagua no ha sumado.